L'évaluation par compétences a de nombreux effets pervers. Elle force les enseignants à atomiser les apprentissages pour pouvoir cocher des cases et fait perdre de vue le but réel.
De plus, les enseignants sont complètement happés par ces tâches d'évaluation et tout le temps qu'ils passent à évaluer chaque micro-compétence les épuise et les éloigne de l'observation réelle de leurs élèves. L'enfant lui-même ne sait plus où il en est et les parents, encore moins.